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La instancia, que agotó cupos en tan solo minutos, busca entregar conocimiento sobre métodos de secuenciación genómica y habilidades bioinformáticas, para analizar conjuntos de datos genómicos grandes y complejos, y es respaldada por tres Centros ANID y dos universidades.

Santiago, viernes 28 julio 2023.- Manejar sistema operativo LINUX a través de líneas de comando en terminal, verificar la calidad de genomas completos, o ensamblar genomas a partir de genomas de referencia, son parte de los objetivos del primer “Taller Bioinformática básica: Y sus aplicaciones en el ensamblaje de genomas de especies no modelo”, que se desarrollará del 31 de julio al 3 de agosto de 2023, de forma presencial, en la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas Universidad de Chile (FCFM). Av. Beauchef 851, Santiago, Región Metropolitana.

El programa contempla trabajos prácticos y la utilización de sistema operativo Linux, para que las y los estudiantes puedan desarrollarán destrezas en el manejo de data science con énfasis en datos de genomas completos. A su vez, se realizarán trabajos prácticos a lo largo de los módulos.

Debido al éxito de la convocatoria, que completó cupos en tan solo minutos, y registró más de 80 participantes, la comisión académica evalúa una nueva versión, orientada a módulos de nivel intermedio y avanzados con análisis genómicos comunes en revistas de alto impacto. La instancia, además contará con los destacados académicos Dra. María José Frugone y Dr. Boris Rebolledo como profesores invitados.

El “Taller Bioinformática básica: Y sus aplicaciones en el ensamblaje de genomas de especies no modelo”, se desarrollará del 31 de julio al 3 de agosto de 2023, y es respaldado por la Sociedad de Genética de Chile (SOCHIGEN), la Pontificia Universidad Católica de Chile, la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas (FCFM) de la Universidad de Chile, el Centro de Regulación del Genoma (CRG), el Núcleo Milenio del Límite de Vida Patagónico (LiLi) y el Instituto Milenio Biodiversidad de Ecosistemas Antárticos y Subantárticos, conocido también como Instituto Milenio BASE;  tres centros de investigación científica de excelencia, pertenecientes a la Iniciativa Científica Milenio de la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo de Chile (ANID).

Acerca de los profesores

DRA. FABIOLA LEÓN

Investigadora Postdoctoral. Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio BASE

Instituto Milenio CRG

MSC. EDUARDO PIZARRO G.

Asistente de Investigación en Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio

BASE e Instituto Milenio CRG

DRA. JULIANA A. VIANNA

Profesora de la Pontificia Universidad Católica de Chile, Instituto Milenio BASE e Instituto Milenio CRG, también de Instituto para el Desarrollo Sustentable UC y Núcleo Milenio LiLi

Acerca de los ayudantes

ING. FORESTAL ELISA GONZÁLEZ

Estudiante de Magíster en Recursos Naturales Pontificia Universidad Católica de Chile, y Núcleo Milenio LiLi

ESTUDIANTE FÍSICA FABIÁN RODRÍGUEZ

Estudiante de Física en la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas (FCFM) de la Universidad de Chile

El programa sinóptico contempla aspectos como la Introducción a la genómica, bioinformática, Conexión y transferencias con Máquinas Remotas, Datos de secuencias genómicas, Remoción de adaptadores, index y barcodes (Trimmomatic, Fastp) y Formatos de alineación: SAM y BAM, entre otros.

Por Marcelo Sotomayor y Nadia Politis

Afiche: Instituto Milenio BASE

El curso virtual se realizará desde el 19 hasta el 30 de septiembre, mientras que el encuentro presencial se realizará del 24 de noviembre hasta el 06 de diciembre en la ciudad de Puerto Williams, región Magallanes y la Antártica Chilena. Las postulaciones se pueden realizar en https://regenec.org/taller/sep2022/

Con el lema “preservando la diversidad genética en la era de la genómica”, el XV Taller Latinoamericano de Genética para la Conservación, se llevará a cabo gracias a la organización de la Red de Genética para la conservación (ReGeneC), del Instituto Milenio Biodiversidad de Ecosistemas Antárticos y Subantárticos (BASE) y del Centro Internacional Cabo de Hornos (CHIC) como instituciones anfitrionas. Tendrá como objetivo revisar y poner en práctica herramientas de análisis actualizadas, fortalecer el desarrollo de proyectos y generar redes entre profesionales.

Según señalan desde el comité organizador de la ReGeneC, el taller se desarrollará por primera vez en formato híbrido, incluyendo una parte virtual y otra presencial. Está dirigido a estudiantes de posgrado y profesionales latinoamericanos involucrados en la genética de la conservación (revisa más requisitos aquí). “Combinaremos conferencias y clases en línea, para luego tener trece días de reuniones presenciales para sesiones prácticas de análisis de datos y discusión de proyectos”, indicaron.

Además, agregaron que “con esta edición esperamos facilitar la incorporación del contenido del taller a los proyectos de investigación de los participantes, con el objetivo de continuar el proceso de desarrollo de capacidades para la preservación de la diversidad biológica en Latinoamérica en un contexto integral que considere, además de aspectos bioecológicos de las especies, aspectos sociales, económicos, e incluso políticos”.

Puerto Williams desde canal Beagle. Imagen: I. Milenio BASE/ C. Barrientos

El Director del Centro Internacional Cabo de Hornos (CHIC), Ricardo Rozzi, sostuvo que “este curso ofrece una oportunidad única al hacerse cargo de la genética, de la conservación, en una de las últimas áreas prístinas que conserva el planeta, una de las zonas con una biodiversidad subantártica mejor conservada del mundo, esto es la Reserva de la Biosfera Cabo de Hornos. Y, además, es una expresión de colaboración entre dos centros de excelencia de Chile: BASE con Milenio y CHIC con Fondos Basales. Colaboración para la conservación”.

Por su parte, en relación con el objetivo del encuentro, el director del Instituto Milenio BASE, Dr. Elie Poulin, dijo que “la idea es que al final del curso, además de los aprendizajes, los estudiantes se vayan con un proyecto mejorado para seguir con sus investigaciones en sus respectivos países. Ese es el punto fuerte de este taller, donde los académicos y profesores de ReGeneC analizan y discuten los proyectos de todos los participantes. Este curso lleva ya años formando nuevas generaciones de investigadores usando herramientas genéticas para la conservación de la biodiversidad y se ha generado una comunidad que va creciendo después de cada curso y sigue conectada”.

Entre las instituciones patrocinantes se encuentran la Asociación Americana de Genética, AGA (American Genetic Assosation), el Instituto de Ecología y Biodiversidad, IEB, y Programa de Biotecnología de la Universidad de las Naciones Unidas para América Latina y el Caribe, UNU-BIOLAC (United Nations University Biotechnology Programme for Latin America and the Caribbean).

Puedes postular hasta el 27 de agosto en el siguiente enlace.

Por: Constanza Barrientos y Nadia Politis